1、护照在国内没有出境之前丢失。办理程序如下：首先通知移民局护照及签证丢失，再通知学校延期开学日期；向当地所在丢失区域派出所报案，并索取报案证明；在当地市级以上出入境管理处指定的报纸登报丢失声明；携带本人身份证及户口本，携带上述两项证明去当地出入境管理处办理补办护照手续，办理手续规定周期为3个月；取得护照后，与使馆取得联系，将报案证明和报纸登报丢失声明复印件递交使馆负责人，办理补贴签证手续。

2、护照在国外丢失，办理程序分两种情况：
（1）第一时间与领事馆取得联系并携带本人护照及签证复印件去中国使领馆,申请挂失办理，大概办理费需要两至三个月。中国领馆会给学生出示一张临时身份证明纸，短期内使用。等到护照办理完毕后，再补贴签证。
（2）也可以将中华人民共和国驻外使领馆出具的有关证明在中国户口所在地由家人帮助申请补发护照手续，取得护照后再寄往日本办理补办签证手续。时间可以灵活掌握。

3、出境后又返回国内丢失护照。可持本人在国外的身份证明(主要指要国外的身份证、居留证、注册的学生证、就职证明)申请补发护照。